本发明公开了一种用于新能源车辆的远程锁车控制系统及控制方法，涉及车辆技术领域。所述用于新能源车辆的远程锁车控制系统包括车联网平台，用于接收用户输入的锁车指令；车联网终端，用于接收所述锁车指令，同时判断所述车辆的状态是否适合锁车，若适合锁车，则发送所述锁车指令至智能安全网关；所述智能安全网关，用于接收所述锁车指令，并将所述锁车指令进行加密；车辆控制器，用于接收加密的所述锁车指令，并控制车辆执行单元执行所述锁车指令；和所述车辆执行单元，用于锁止车辆。本发明还提供了相应的控制方法。本发明不仅能够完成新能源车辆的远程锁车控制功能，还使得整个远程锁车控制系统的数据传输得到了有效的安全保障。