本发明公开了一种可变光强的膈神经光刺激系统，包括肌电采集装置、控制器、激光器、光纤和通光装置；肌电采集装置用于获取膈肌收缩信号，并将膈肌收缩信号传递给控制器；控制器用于接收肌电采集装置传输的膈肌收缩信号，并且根据膈肌收缩信号向激光器发出发射特定强度红外脉冲激光的指令；激光器用于根据控制器发出的指令发射特定强度红外脉冲激光；光纤连接于激光器与通光装置之间；通光装置内设置有光路反射镜面，用于改变红外脉冲激光光路。使用本发明系统可通过红外脉冲激光直接照射神经组织，引起组织中瞬时能量积累，以此建立温度梯度，使组织中产生光热，从而诱发神经活动，提高了使用的安全性和精准性。