本发明涉及一种公共交通付费系统及方法，属于公共交通付费的技术领域，用于解决现有技术中公共交通一卡通乘客上车刷卡下车忘记刷卡会给自身造成经济损失的问题，该系统包括乘客使用终端、公共交通终端以及位置确定模块，当位置确定模块检测到乘客使用终端位于公共交通工具内时，公共交通终端与乘客使用终端近程无线通讯连接，且公共交通终端实时更新乘客使用终端内的交易信息，当乘客下车后，乘客使用终端与公共交通终端由于距离过远而断开连接。这种方式公共交通终端更新乘客使用终端的交易信息是实时的，断开连接即停止更新，从而避免了乘客下车忘记刷卡带来的经济损失。