本发明属于除草剂技术领域，涉及一种海洋真菌来源fusarisetin类除草剂、制备方法及应用，从海洋真菌木贼镰刀菌当中分离鉴定出两个结构新颖的fusarisetin类化合物fusarisetins C和fusarisetinsD，其中fusarisetin D为首个具有6/6十氢化萘和5/5二环嵌合的fusarisetin类化合物；同时发现了新化合物和已知化合物fusarisetins A和fusarisetinsB对反枝苋等双子叶植物的除草活性；对反枝苋等双子叶植物种子萌发和根茎生长具有明显的抑制作用，而且对移栽的农作物来说，对幼苗无明显毒副作用。