本发明公开了提升调试和运检效率的智能变电站配置文件管控方法，该方法包括如下步骤：步骤S1：收集各变电站对应厂家IED设备的ICD模型文件，并根据设计图纸和虚端子表进行组态集成，形成配置初调版SCD文件；步骤S2：根据厂家私有配置信息及步骤S1形成的初调版SCD文件来生成CID配置文件，并把CID配置文件下载至IED设备上进行二次调试，调试成功生成中间版SCD文件；步骤S3：用户根据中间版SCD文件上传至管控系统进行审核；步骤S4：当后期变电站运行维护及改扩建时，根据步骤S3中相关智能变电站运行版本SCD文件，进行配置文件的一致性校核分析，形成更新版SCD运行文件并进行存储归档。