本发明涉及L‑苹果酸高产菌株及其应用，其分类命名为黑曲霉（Aspergillus niger）L01，保藏编号为CCTCC NO：M 2019458。本发明以购买自中国工业微生物菌种保藏中心（CICC）的黑曲霉Aspergillus niger CICC NO：40567为出发菌株，采用ARTP物理诱变结合自然筛选得到高产L‑苹果酸的突变株Aspergillus nigerL01，该突变株L‑苹果酸的产量高，不仅能解决黄曲霉菌株发酵过程中产生黄曲霉毒素的问题，而且黑曲霉产柠檬酸的工艺目前在工业上已经成熟，可直接利用现有过剩的柠檬酸生产装置，助推企业的转型升级。