本发明涉及一种配电系统微型同步相量测量单元优化配置方法，其技术特点在于：包括以下步骤：步骤1、采用MSE作为标准状态估计精度评价指标；步骤2、基于步骤1的标准状态估计精度评价指标，从任意一致的系统真实状态出发，以MSE最小为目标，μPMU配置数量为约束，建立配电系统μPMU优化配置模型，进而寻求使状态估计MSE最小的μPMU配置方案；步骤3、求解步骤2的配电系统μPMU优化配置模型，获得最终μPMU优化配置结果。本发明可采用商业求解器快速获得高质量的可行解，为规划运行人员提供满足工程需要的配置方案。