本发明提供了核孔蛋白Nup54在制备治疗心肌损伤或者急性心梗的药物中的应用。本发明还提供了一种载体，含有编码核孔蛋白Nup54的基因。还提供了一种重组腺病毒载体，含有编码核孔蛋白Nup54的基因。还提供了一种腺病毒，含有编码核孔蛋白Nup54的基因。还提供了上述载体、重组腺病毒载体、腺病毒在制备治疗心肌损伤或者急性心梗的药物中的应用。通过实验显示，通过核孔蛋白Nup54基因转导，在心梗后，通过调控Serca2a蛋白的核浆转运维持心脏功能，减轻心肌缺血造成的心脏损害，在心梗早期保护心脏功能。