本发明公开了一种使用葡萄酵母菌制作蓝莓酵素的方法，包括：(1)采用新鲜水晶葡萄果梗处酵母菌，经过分离纯化在培养，得到A品；(2)采用有引流装置的发酵罐，洗净后高温杀菌消毒，将洗净后的蓝莓破碎后装入发酵罐后，继续加入葡萄酵母菌悬浮液、酵母浸膏和冰糖，混匀，得B品；(3)B品变温发酵，得C品；(4)C品继续培养后，灭菌，蓝莓酵素产品形成。本发明方法采用单一蓝莓果实发酵，变温发酵，在发酵的过程中参数变化简单，容易控制，大大缩短了蓝莓酵素制作周期，节约了生产成本，提高了蓝莓酵素生产效率。且得到的蓝莓酵素不会遭到杂菌的污染，产品质量容易控制，有利于蓝莓酵素产品的开发和利用，从而提高蓝莓酵素的经济价值。