本发明提供一种核酸分析装置，其包括一槽体、一流体输送单元、一温度控制单元、一旋转驱动单元及至少一光学单元。槽体包括安装于其内的一卡匣，流体输送单元与槽体连接，并适于输送卡匣内的试剂，以进行试样纯化及/或核酸萃取。温度控制单元设置于槽体内，并适于提供一默认温度，以进行核酸扩增。旋转驱动单元与槽体连接且包括一运动控制单元，可在试样纯化及/或核酸萃取期间对卡匣施压或夹持，并在核酸扩增及/或检测期间以默认程序旋转卡匣。至少一光学单元设置于槽体上，并包括多个多个光学组件，以进行检测。