本发明公开了一种电子式互感器与变电站主站系统通信安全的综合评估方法，包括分析电子式互感器与智能变电站主站系统通信安全的影响因素，构建电子式互感器与智能变电站主站系统通信安全综合评估指标体系；基于二项系数法，提出电子式互感器与智能变电站主站系统通信安全综合评估的指标赋权方法；对电子式互感器与智能变电站主站系统通信安全进行综合评价。本发明有效评估了电子式互感器与智能变电站主站系统之间的通信安全，为智能变电站精益化运维提供可靠的数据源支撑。