本发明提供一种隧道管节间密封结构及其施工方法，用于密封两个相邻管节之间的接缝。隧道管节间密封结构包括位于两个管节的接缝处并设于管节内的内衬管及两个密封单元，两个密封单元分别位于内衬管的两端且对称设置；每个密封单元包括支撑板、密封件、挤压板、封堵板及螺纹件，支撑板环设于内衬管的一端，密封件收容于支撑板、内衬管及管节围成的收容腔中，挤压板收容于收容腔中并位于密封件远离内衬管的一侧，封堵板可拆卸地固定连接于支撑板，螺纹件穿设于封堵板并位于挤压板远离密封件的一侧，以旋转推动挤压板挤压密封件。本发明提供的隧道管节间密封结构及其施工方法简单实用，能够使活动的隧道管节之间保持良好的密封止水效果。