本发明具体涉及一种启动子及其应用，尤其涉及一种启动子及其用于表达疟原虫的外源基因上的应用，所述启动子选自：(1)包含有SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列且在疟原虫中以稳定期特异性方式显示出启动子活性的DNA或其片段；或(2)与SEQ ID NO.1所示的核苷酸序列具有90％以上，优选95％以上同源性且在疟原虫中以稳定期特异性方式显示出启动子活性的DNA或其片段。本发明通过合成NT1‑9(SEQ ID NO.1)序列，发现以NT1‑9序列为核心的核苷酸序列作为启动子都具有转录活性，可以适用不同的应用场合。