本发明涉及一种核电站控制系统安全功能自动测试系统及方法，属于控制系统技术领域，解决了现有技术下核电站控制系统安全功能测试中测试效率低的问题。一种核电站控制系统安全功能自动测试系统，包括测试部署平台和测试装置，所述测试装置与被测系统各子系统通信，实现系统级集成测试；所述测试装置包括：数据发送模块，用于按照测试用例步骤，将故障工况数据直接发送至被测系统各子系统，数据回读模块，用于回读被测系统安全功能实现的安全逻辑中间逻辑点和测试输出数据；数据对比模块，用于将回读数据与测试用例上输出的理论数据做对比，得到对比结果数据。实现了核电站控制系统安全功能的远程自动测试，提高了测试质量和测试效率。