一种阶梯供水系统及其分层分布式控制方法，该供水系统包括取水泵站、加压泵站、一号至四号水池、供水管线、各供水管线上设置的控制阀门以及控制柜；取水泵站的进水口通过供水管线连接水库，取水泵站的出水口分别连接一、三、四号水池的进水口；加压泵站的高程低于一号水池，前述加压泵站的进水口通过供水管线连接一号水池，出水口连接二号水池的进水口；控制柜的各控制信号端分别与取水泵站、加压泵站以及各控制阀门的对应控制信号端相连。本发明利用原始地形合理建不同高程的水池，节省成本；低水头水池给高程低的用户供水，高水头水池给高程大的用户供水，充分利用水池水势能；通过二次加压供水，极大降低成本且节省能源，符合节能要求。