本发明公开了一种用于声纳系统测试的数字延时系统及其实现方法，系统包括第一延时单元、同步单元和第二延时单元；方法包括：根据第一延时值，通过第一延时单元将原始信号波形数据转化成带有相应数量时钟延时的信号波形数据；同步单元通过高频时钟对D/A时钟以及转化后的信号波形数据进行采样，并对高频时钟和采样结果进行同步处理；根据第二延时值，第二延时单元对同步处理的结果进行延时处理。相较于现有仅通过一个延时单元进行数字延时的方法，本发明采用两个延时单元进行两级延时，在保证延时量和延时精度的同时，还降低了对硬件资源的需求量，成本较低，可广泛应用于声纳系统测试技术领域。