本发明公开了一种纤维素蚕丝蛋白复合纤维的制备方法，包括如下步骤：a)将蚕丝蛋白和纤维素溶解在离子液体水溶液中，制得均相混合纺丝原液；b)所得纺丝原液经过滤、纺丝、凝固、拉伸、水洗、漂白、上油、干燥，即得所述纤维素蚕丝蛋白复合纤维；所用的离子液体是由90～110质量份的1‑丁基‑3‑甲基咪唑氯盐与5～15质量份的联1,4‑二[1‑(3‑甲基咪唑)]丁基二氯盐和5～15质量份的联1,4‑二[1‑(3‑甲基咪唑)]丁基二高氯酸盐混合得到。本发明实现了蛋白质与纤维素共溶共生制备复合纤维的工业化生产，具有极强的实用价值。