本发明涉及一种FPGA的配置存储器上电初始化的电路和方法，该电路包括：译码电路、驱动电路和配置存储器，当第1次写0时，译码电路打开配置存储器中的一个地址对应的一个字线，驱动电路将一个字线的内容写为0；当第i次写0时，译码电路打开配置存储器中的至少一个地址对应的至少一个字线，驱动电路将至少一个字线中每个字线的内容写为0，至少一个地址的数量小于或等于前i‑1次已完成写0的地址的总和，i取大于或者等于2的正整数，从而使得配置存储器上电初始化过程中的写0操作更加容易，并且能够极大的缩短初始化的周期。