本发明涉及一种结合主导生态功能与生态退化程度的生态修复分区方法，获取待研究区的原始数据，对原始数据进行预处理和信息提取，绘制底层数据图；计算水源涵养、防风固沙、土壤保持和生物多样性维持这四个生态功能要素；并计算生态退化程度，生成生态退化程度图；分三级划分生态修复分区，生成各级分区图；将各级分区图进行叠加，生成最终的生态修复分区图。本发明所述方法克服了以往生态功能区划只重视生态系统主要服务功能空间布局的局限性，实现了生态修复分区的定量划分，提高了生态修复工程的针对性和精确性，节省了人力、物力。