本发明涉及一种耐低氧团头鲂的构建方法，所述的构建方法包括以下步骤：(1)构建耐低氧F1群体：团头鲂低氧胁迫选育出耐低氧F1群体；(2)构建耐低氧F2群体：以耐低氧F1群体团头鲂为亲本构建F2家系，F2家系1龄阶段进行低氧胁迫养殖，2龄阶段常氧养殖；(3)构建耐低氧F3群体：以耐低氧F2群体团头鲂为亲本构建自交F3群体，或以耐低氧F2雌性团头鲂为母本，用紫外灭活的鲤鱼精子诱导构建团头鲂减数、有丝分裂雌核发育F3群体。其优点表现在：本发明培育出了团头鲂耐低氧的新品种，耐低氧能力显著提高，具备生长优势，且生长优势性状稳定遗传与累积。