本发明公开了一种N‑酰基高丝氨酸内酯酶及其编码基因和重组菌。所述N‑酰基高丝氨酸内酯酶的氨基酸序列如SEQ ID NO.2所示。本发明还公开了含有所述N‑酰基高丝氨酸内酯酶编码基因的重组菌，所述重组菌是将所述N‑酰基高丝氨酸内酯酶编码基因构建大肠杆菌重组表达载体，然后导入到大肠杆菌中，筛选得到表达N‑酰基高丝氨酸内酯酶的转基因重组菌。本发明所述的N‑酰基高丝氨酸内酯酶对不同碳链长度及修饰的N‑酰基高丝氨酸内酯(AHL分子)均有良好的降解作用。