一种环保型温室消毒方法，目的是杀灭土壤中有害微生物和害虫、提高温室大棚消毒效果、减少化学药剂使用；本发明在温室大棚休闲期间，将温室大棚密闭，土壤湿度保持在70%以上；每亩施用8‑15方复合菌肥，复合菌肥包括未经腐熟的鸡粪和有益的微生物菌剂,该微生物菌剂包括细菌1010CFU/g、放线菌108CFU/g、酵母菌108CFU/g和霉菌108CFU/g；微生物菌剂在鸡粪中的添加量为500g/方；用透明塑料薄膜将温室地面全部覆盖；利用阳光辐射使土壤温度升高到50℃以上，以达到杀灭土壤中有害微生物和害虫的目的；土壤处理时间要达到30天以上。