本发明公开了一种快速鉴别棉麻纤维的方法包括以下步骤：(1)建立全棉、全麻样品的取向度与全棉、全麻特征波长对应的光谱值之间的方程；(2)采集待测样品的反射中红外光谱，在待测样品的反射中红外光谱中找出与全棉、全麻特征波长对应的待测样品的光谱值，将待测样品的光谱值代入全棉、全麻方程，从而得到待测样品的取向度；(3)将待测样品的取向度与全棉、全麻样品的取向度的取值范围进行比较，从而判定待测样品是全棉纤维或全麻纤维。本发明的方法不仅操作简单，而且能提高检测效率、降低检测人员的工作强度及对检测人员的要求、保证检测样品的完整性、满足大批量快速检测的需要。