本发明的双能/双视角的高能X射线透视成像系统具备：检查通道；电子加速器；屏蔽准直装置，包括屏蔽结构、设置在所述屏蔽结构内的用于引出低能平面扇形X射线束流的第一准直器以及用于引出高能平面扇形X射线束流的第二准直器；低能探测器阵列，用于接收来自所述第一准直器的X射线束流；高能探测器阵列，用于接收来自所述第二准直器的X射线束流；信号分析与图像处理子系统、以及电源与控制子系统，所述第一准直器和所述第二准直器位于电子束流的轴线的同一侧，所述第一准直器、所述低能探测器阵列、电子束流打靶产生的靶点位于第一平面内，所述第二准直器、所述高能探测器阵列、电子束流打靶产生的靶点位于第二平面内。