本发明公开了一种碳基磁性固体碱催化剂及其应用。将碳粉、金属盐溶液、沉淀剂和纯水混合均匀，反应生成碱性水溶液和混合沉淀物，将混合沉淀物洗涤至中性，经干燥、粉碎、煅烧获得碳基磁性负载材料，再将碳基磁性负载材料、硅酸盐、纯水均匀混合，旋转蒸发制备成胶状物，胶状物再经煅烧、研磨粉碎后获得碳基磁性固体碱催化剂。将所得催化剂与植物油和甲醇配置成混合液并倒入反应瓶，反应后获得甘油和生物柴油混合液，将混合液置于外磁场旁分离回收催化剂，静置混合液分层获得甘油和生物柴油。该催化剂催化性能稳定、生产方法简单、生产成本低廉、容易回收重复利用，并且催化制备生物柴油效率高，具有良好的市场应用前景。