本发明的一种具有数据拆分加密功能的嵌入式系统的使用方法，通过拆分加密实现嵌入式系统所存储数据的有效分离存储；嵌入式系统向片外非易失存储器写数据时以数据块为单位将被写入数据基于全文关联变换后拆分成主体信息数据及抽离信息数据，并分别写入不同的存储介质，实现文件数据的安全有效分离存储；嵌入式系统必须基于主体信息数据及抽离信息数据关联、反变换等操作才可实现对片外存储器内所存储数据的读取操作。本发明有效克服了现有嵌入式系统的信息安全管理中的种种缺点，为嵌入式系统防扩散、防窃取、防破解的信息安全提供一种安全且易用的新方法，从而可为嵌入式系统提供高度防护功能。