本发明涉及分子生物学技术领域，公开了一种基于磁性微珠的样品无转移低场NMR稀有细胞检测方法，包含以下步骤：(1)分别制备目标稀有细胞悬浮液的标准样本和待测样本；(2)分别加入偶联有目标稀有细胞特异表达抗体的核磁共振造影剂，混合均匀后立即用低场核磁共振分析仪分别对标准样本和待检样本进行弛豫时间测定；(3)使核磁共振造影剂与样本中的稀有细胞进行免疫反应富集后，再次用低场核磁共振分析仪分别对标准样本和待检样本进行弛豫时间测定；(4)计算弛豫时间改变量，绘制标准曲线，得出待检样本中目标稀有细胞的含量。本发明可简便、快速、高特异性和高灵敏度地检测生物体液样本中的稀有细胞，且由于两次检测之间没有样品的转移过程可获得较高准确率。