本发明提供一种不论正极的种类如何，能够抑制负极的金属异物的局部析出，难以发生短路的锂二次电池的制造方法。该制造方法，包括：组装单元电池的工序，该单元电池含有正极、负极和非水电解质；微充电工序，该工序对于上述组装了的单元电池，在进行初始调整充电之前进行微充电，直到相对于金属锂（Li）标准电极的正极电位，达到超过Me溶解电位的电位，该Me溶解电位是预先设定的混杂预计金属种（Me）的溶解开始的电位；和Me溶解电位保持工序，该工序在上述微充电后，将上述单元电池的正极电位在上述Me溶解电位以上保持规定的时间。