一种ISG高度混合动力汽车动力总成系统及其控制方法，系统包括发动机、ISG电机和主电机。ISG电机、主电机分别通过一个离合器和电功率分流器相连，发动机通过一个离合器和电功率分流器与中央功率分流器机械连接；动力经过中央功率分流器后再经过变速器和驱动桥后输送给驱动轮；整车控制器通过控制整车需求转矩和发动机实际输出转矩之差，控制相应的离合器结合或分离、发动机运行或停止，实现工作模式的转换和功率的分配；ISG电机和主电机协调工作、辅助发动机运行在高效工作区内，提高了发动机的效率，减少了纯电动时或再生制动时的能量损失，最终提高了整车的燃油经济性。