本发明公开了一种内置斜腿刚架预应力混凝土变截面箱梁桥，包括设置有底板箱底板、底板箱顶板和腹板的底板箱、顶板和桥墩，箱梁内部设置有中腹板和横隔板，由跨中向桥墩方向沿着箱梁纵向设置有上弯锚固板；所述底板箱上方设置有，包括内置纵梁、内置上斜腿和内置下斜腿的斜腿刚架结构，内置纵梁由跨中向桥墩方向沿箱梁纵向向上倾斜或弯起设置；内置纵梁、底板箱底板以及上弯锚固板均设置有上弯布置的底板索。本发明还提供了一种内置斜腿刚架预应力混凝土变截面箱梁桥的施工方法。本发明所提供的梁桥和施工方法，可以使底板索布局更为合理，上弯布置的底板索可以提供向上的径向力，消除或减小二期恒载和部分车辆荷载所产生的向下的作用力。