本发明提供一种含蛋清蛋白肽的肠内营养制剂及其制备方法，本发明营养制剂含如下质量百分数计的组分：蛋清蛋白肽粉10~20%，大豆蛋白粉5~15%，麦芽糊精50~75%，中链甘油三酯5~10%，橄榄油2~5%，益生元1~2%，复合维生素0.2~1%，制备方法为：将中链甘油三酯和橄榄油进行微胶囊化包裹后与蛋清蛋白肽粉、大豆蛋白肽粉、益生元、复合维生素充分混匀，再与麦芽糊精进行二次混合即可，该制剂营养全面，尤其含有蛋清短肽类、中链脂肪酸、单不饱和脂肪酸、益生元等成分，易于消化吸收，可作为营养补充剂使用，尤其适合为肠道功能障碍者提供营养支持。