本发明涉及新能源汽车领域，公开了一种汽车双燃料掺烧方法及控制系统。该汽车双燃料掺烧方法可根据发动机转速在发动机燃料的一个喷射周期内实现汽油和代用燃料的掺烧，同时公开了一种汽车双燃料控制系统，包括控制器、模式选择开关和传感器，模式选择开关和传感器均与控制器以电缆进行电连接，模式选择开关供驾驶员选择当前工作模式，共有汽油模式和代用燃料模式可供选择，当汽车工作在代用燃料模式下，控制器能控制汽车发动机燃料喷嘴一个喷射周期内，分别喷射一段时间的汽油和代用燃料。本发明能实现汽油和代用燃料共同使用，解决了在使用代用燃料时负载较大的情况下动力不足的问题。