本发明涉及管理电池健康状态差异的成比例主动充电状态平衡方法，具体提供一种用于具有不同健康状态的电池之间的功率管理的方法和系统。两个或更多个电池组以矩形波脉冲被开启或关闭从而为多绕组变压器通电，并且所述变压器的输出用于为负载提供功率。因为所述电池组的充电状态以不同比率降低，每个电池组的切换脉冲的占空比被设置为相对于其他电池组与其充电状态成比例。具有最大充电状态的电池组具有最长的工作时间并且为所述变压器提供最多的能量，但所有电池组都贡献能量。通过比例积分控制模块基于所述负载处的电压测量值来计算基础占空比。能量贡献被管理使得充电状态甚至在所述电池组具有广泛不同的健康状态时也不会产生差异。