本发明公开了一种去除二级蛋氨酸母液中杂质的方法及装置；本发明的方法为：将二级蛋氨酸母液加热至30~100℃，然后往每升二级蛋氨酸母液中加入1~10g吸附剂，保温吸附10min~90min，最后过滤吸附后的二级蛋氨酸母液，所述吸附剂为硅藻土、活性炭或活性白土；本发明的装置包括待处理母液储罐、吸附罐、过滤器和成品母液储罐，所述待处理母液储罐与吸附罐的入口连通，所述吸附罐的出口与过滤器的入口连通，所述过滤器的滤液出口与成品母液储罐连通；本发明降低了母液中的杂质积累，得到了质量更高的母液，从而提高蛋氨酸和硫酸钠的收率，同时由质量更高的母液回收得到的蛋氨酸和硫酸钠的产品质量更加优化。