本发明涉及温室大棚农作物种植领域，具体为一种温室、大棚土壤还原、消毒复合微生物菌剂及土壤消毒方法，解决现有方法存在诸多缺陷的问题，包括细菌、放线菌、酵母菌、霉菌混合的复合微生物菌剂，消毒步骤为选择6～9月份为消毒时期，作物收获后，在地面铺撒农作物秸秆、有机肥、复合微生物菌剂；深耕土壤层，做成小高畦；用塑料薄膜覆盖畦面，然后在膜下灌满水，土壤湿度达到100%，密封地膜，覆盖大棚塑料膜，封闭时间为20-25天；揭开放风，除去地膜，进行种植。是一种无毒、无害、无污染、无残留的土壤消毒方法，杀灭了土壤耕作层的病原菌、虫卵等，增加了土壤有机物，改善了土壤物化结构，培肥了地力，为丰产、提高产品质量打下良好基础。