本发明提供了一种费托合成浆态床反应器中费托蜡与催化剂过滤及反冲方法，包括以下步骤：步骤1：生产模式下，开启清液抽出系统，将费托蜡抽出至已设定好压力的粗蜡产物缓冲罐中；步骤2：生产模式下，当反冲时间间隔值达到设定值时，开启反冲系统对滤芯进行反冲；步骤3：当反冲时间达到设定值时，关闭反冲系统，重新将费托蜡抽出至已设定好压力的粗蜡产物缓冲罐中。本发明通过自动对过滤系统和反冲系统控制，根据时间周期或者反冲动作压差对滤芯自动反冲洗，有效地保证了费托蜡能长周期稳定有效的从反应器抽出，实现费托合成浆态床反应器平稳连续运行。