本发明涉及全钒氧化还原液流电池隔膜领域，具体是一种适用于全钒氧化还原液流电池的全氟磺酸树脂和磺化聚醚醚酮复合隔膜的制备方法，解决现有技术中隔膜稳定性较差、阻钒性能差、工艺复杂、价格昂贵等问题。以全氟磺酸树脂和聚醚醚酮为原料，将全氟磺酸树脂溶于有机溶剂，形成全氟磺酸树脂溶液，将聚醚醚酮磺化处理，然后溶于有机溶剂，形成磺化聚醚醚酮溶液。将全氟磺酸溶液与磺化聚醚醚酮溶液共混，制备混合溶液。将聚丙烯镍氢电池用隔膜做为增强膜与混合溶液一起采用分步流延、涂浆、浸胶等成膜方法来制备复合隔膜。本发明制备的复合隔膜可广泛地应用于全钒氧化还原液流电池领域。