一种以含酸油脂为原料制备生物柴油的方法。在活性炭固载酸性催化剂存在的条件下，利用动、植物油中的游离脂肪酸与甲醇发生酯化反应以降低原料油酸值；再在碱催化剂存在的条件下，利用动、植物油中的甘油三酯与甲醇进一步发生酯交换反应以制备生物柴油；反应结束后静置分层，上层为粗制生物柴油，下层为甘油、甲醇、皂及碱催化剂混合物；将上层粗制生物柴油经常压蒸馏回收甲醇后，再经水洗并减压蒸馏可得精制生物柴油，下层经常压蒸馏回收甲醇后，再经水洗并减压蒸馏可得到饲料级甘油，所蒸馏出的甲醇均可回收再利用。本发明的效果和益处是采用的活性炭固载酸性催化剂价格低廉，在后处理过程中易于除去，可重复使用，具有环境友好、成本低且高效等特点。