一种基于高通量测序数据的计算流程调度系统

    公开(公告)号:CN113535326A

    公开(公告)日:2021-10-22

    申请号:CN202110778384.X

    申请日:2021-07-09

    Abstract: 本发明实施例提供一种基于高通量测序数据的计算流程调度系统,采用微服务架构,整合多种计算资源、Cromwell调度引擎,实现分析任务的有效调度,并在此基础上与App规范以及为App分发复用而定制开发的App Store相结合,实现App的高效开发、测试、复用以及完成多组学数据的分析。通过Pipeline分析过程管理模块,将整个分析过程中涉及的参数和文件等通过版本控制工具,进行有效的管理,为后续项目溯源、Bug排查、数据分析复现等提供可靠的基础;极大简化了生物信息数据分析流程,实现了分析流程的可控,可复用,可溯源,应用场景较为广泛。

    预测局部晚期宫颈癌放疗后肿瘤复发模式的生物标志物组合及其用途

    公开(公告)号:CN119510763B

    公开(公告)日:2025-05-16

    申请号:CN202411340224.7

    申请日:2024-09-25

    Inventor: 景莹 范晓恺

    Abstract: 本发明属于宫颈癌复发模式预测的技术领域,具体公开了一种预测局部晚期宫颈癌放疗后肿瘤复发模式的生物标志物组合及其用途。所述的生物标志物组合包括细胞衰老标志物和EMT标志物,该组合与患者肿瘤的不同复发模式相关,研究表明细胞衰老通路和EMT相关基因的表达水平可以作为预测放疗后LACC肿瘤复发模式的生物标志物。本发明还提供了所述标志物组合在制备用于预测局部晚期宫颈癌放疗后肿瘤复发模式的产品中的应用,可以用来预测或诊断局部晚期宫颈癌放疗后肿瘤的局部复发和远处复发,为提前预判患者放疗后的预后提供了新工具。

    生物数据实体标注方法、系统、电子设备及存储介质

    公开(公告)号:CN119830858A

    公开(公告)日:2025-04-15

    申请号:CN202411671289.X

    申请日:2024-11-21

    Abstract: 本申请提供了生物数据实体标注方法、系统、电子设备及存储介质,该方法包括:a.获取待标注生物数据;b.基于所述待标注生物数据设计标注提示词;c.采用提示词拆解方法,对所述标注提示词进行拆分,获得多个子提示词;d.将所述待标注生物数据和第一子提示词输入至预训练大语言模型中,确定第一实体标注数据;e.循环步骤d,直至获得最后子提示词的实体标注数据;其中,所述提示词拆解方法选自思维链技术或分步提问法中的至少之一。该方法适于零标注生物数据集的实体标注,显著降低了专业壁垒,减少对领域专家知识的依赖,同时提高了标注的效率和准确性。此外,还减少对大规模标注数据的依赖,降低训练和标注成本,灵活适用于不同的生物医学领域。

    一种近红外免疫荧光偶连物及其应用

    公开(公告)号:CN119701020A

    公开(公告)日:2025-03-28

    申请号:CN202411889166.3

    申请日:2024-12-20

    Abstract: 本发明属于生物检测技术领域,具体涉及一种近红外免疫荧光偶连物及其应用。本发明发现近红外荧光染料能够与抗体偶联形成偶连物,可以载入修饰后的壳聚糖载体中,从而制备出具有成像功能的可以口服的近红外免疫荧光探针。近红外荧光染料与抗体的偶连物在近红外区域700‑1700nm范围内均有发射波长覆盖,具有较低的光散射、较高的活体成像分辨率以及较深的穿透深度;并且近红外荧光染料与抗体的偶连物具有成本低廉、生物安全、适于成药等优势。基于式I的修饰后壳聚糖负载的近红外荧光染料与抗体的偶连物可通过口服型递送、静脉注射等方式进行给药,具有较好的依从性。

    预测局部晚期宫颈癌放疗后肿瘤复发模式的生物标志物组合及其用途

    公开(公告)号:CN119510763A

    公开(公告)日:2025-02-25

    申请号:CN202411340224.7

    申请日:2024-09-25

    Inventor: 景莹 范晓恺

    Abstract: 本发明属于宫颈癌复发模式预测的技术领域,具体公开了一种预测局部晚期宫颈癌放疗后肿瘤复发模式的生物标志物组合及其用途。所述的生物标志物组合包括细胞衰老标志物和EMT标志物,该组合与患者肿瘤的不同复发模式相关,研究表明细胞衰老通路和EMT相关基因的表达水平可以作为预测放疗后LACC肿瘤复发模式的生物标志物。本发明还提供了所述标志物组合在制备用于预测局部晚期宫颈癌放疗后肿瘤复发模式的产品中的应用,可以用来预测或诊断局部晚期宫颈癌放疗后肿瘤的局部复发和远处复发,为提前预判患者放疗后的预后提供了新工具。

    HPC的登录节点及其管理方法、系统、设备及存储介质

    公开(公告)号:CN119271514A

    公开(公告)日:2025-01-07

    申请号:CN202411243162.8

    申请日:2024-09-05

    Inventor: 唐川 卢振兴 梅斌

    Abstract: 本申请涉及HPC的登录节点及其管理方法、系统、设备及存储介质。前述登录节点包括:指令接受模块,用于接受用户指令访问资源节点;用户行为检测模块,用于分析所述用户的操作行为;操作建议模块,用于基于所述用户行为检测模块的检测结果和所述HPC的运行状态为用户反馈建议的操作。前述HPC登录节点通过集成用户行为检测和操作建议模块,能够实时分析用户操作行为并提供个性化的优化建议,有效提升用户体验和工作效率。该系统不仅优化了HPC资源的利用率,还增强了集群的自适应性和安全性,同时通过用户反馈不断改进建议策略,实现了资源管理的持续优化,提高了HPC的整体效能和用户使用体验。

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