公开(公告)号：CN114276417A

公开(公告)日：2022-04-05

申请号：CN202111470420.2

申请日：2021-12-03

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 张文利 ,  田瑞平 ,  史依宁 ,  冯逸龙 ,  罗振宇 ,  马星 ,  杨莹 ,  韩琪

IPC: C07K14/00 ,  C12N15/82 ,  C12N15/11 ,  C12N15/65 ,  C12Q1/6869

Abstract: 本发明公开了一种在植物正常生理条件下鉴定全基因组DNA鸟嘌呤四联体位点的方法，该方法在植物正常生理条件下，利用可以在植物体内表达的且特异结合DNA鸟嘌呤四联体位点的优化蛋白，在全基因组水平鉴定基因组DNA鸟嘌呤四联体位点的高能量测序方法，属于生物技术应用领域。该方法是首次利用在植物中表达的G4P蛋白，在植物生理条件下，在全基因组水平鉴定鸟嘌呤四联体位点的方法。整个方法流程简单，耗时较短，DNA片段化可视化效果强。因此，利用本方法提供的核苷酸序列和操作步骤，理论上可在全基因组水平鉴定多种植物的DNA鸟嘌呤四联体位点。

公开(公告)号：CN109706236B

公开(公告)日：2021-08-13

申请号：CN201910108157.9

申请日：2019-02-02

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 张文利 ,  林堪德 ,  郑东洋 ,  陶申童 ,  冯逸龙 ,  陈莉芬 ,  张鹏越

IPC: C12Q1/6869

Abstract: 本发明公开一种利用微球菌核酸酶鉴定植物基因组开放性染色质位点的方法，该方法包括如下步骤：(1)交联植物材料；(2)提取纯化植物材料的细胞核；(3)不同浓度的MNase酶切消化细胞核；(4)1.5％琼脂糖凝胶电泳检测MNase酶切效果；(5)选取合适的MNase酶切细胞核DNA再次进行1.5％琼脂糖凝胶电泳分离，回收DNA片段构建Illumina测序文库并进行测序；(6)对测序数据进行生物信息学分析，鉴定全基因组MH位点。整个方法流程简单，耗时较短，一个周期大约需要2.5天，酶切效果可视化效果强，适合应用于多数植物物种。可直接用于鉴定功能性DNA元件的核心区域。

公开(公告)号：CN105950641B

公开(公告)日：2019-06-14

申请号：CN201610438482.8

申请日：2016-06-18

Applicant: 南京农业大学

Inventor： 张文利 ,  汪西蒙 ,  方圆 ,  王磊 ,  潘秀才

IPC: C12N15/60 ,  C12N9/88 ,  C12N15/82 ,  A01H5/00

Abstract: 本发明公开了一个嵌合型RbcS cTP基因及其表达载体和应用。该基因由拟南芥RbcS cTP的N‑端插入到玉米RbcS cTP的N‑端和中间结构域之间形成，其cDNA序列如SEQ ID NO.2所示。玉米RbcS cTP基因，其cDNA序列如SEQ ID NO.1所示。所述的嵌合型RbcS cTP基因能在将外源基因转入到单子叶和/或双子叶植物叶绿体中应用。