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公开(公告)号：CN117805215A
公开(公告)日：2024-04-02
申请号：CN202311785658.3
申请日：2023-12-22
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种基于质谱法构建的代谢指纹图谱及其衍生生物标志物组合及其筛选方法，涉及生物技术领域。单一血浆代谢指纹图谱衍生标志物组合包括甘油酸、γ‑丁内酯、4‑羟基丁酸、琥珀酸、酮亮氨酸、多巴胺和葡萄糖。复合生物标志物组合包括分别从血浆和脑脊液代谢指纹图谱中获得的代谢生物标志物组合，包括苯醌、尿嘧啶和丁酮二酸和葡萄糖、4‑羟基丁酸、3,4‑二羟基苯乙酸和α‑酮异戊酸。以及单一生物体液生物标志物组合和复合生物标志物组合的筛选方法。本发明通过纳米颗粒增强激光解吸‑电离质谱平台、机器学习和统计分析筛选出单一来源生物标志物组合和复合生物标志物组合。
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公开(公告)号：CN115452933A
公开(公告)日：2022-12-09
申请号：CN202211239970.8
申请日：2022-10-10
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/64
Abstract: 本发明公开了一种多囊卵巢综合征诊断和分型一体化模型构建方法，涉及代谢组学分析技术领域。所述方法包括：使用纳米基质辅助的激光解析电离质谱技术，对多囊卵巢综合征患者和健康志愿者的血清样本进行代谢指纹谱图分析；将得到的代谢指纹谱图进行机器学习，构建针对多囊卵巢综合征诊断和分型的一体化模型；应用构建的一体化模型进行多囊卵巢综合征诊断和分型的代谢生物标志物鉴别。本发明通过引入NPELDI MS实现了痕量血清样品的直接代谢指纹图谱，具有代谢分子选择性(根据尺寸排他效应的小分子特异性电离)、高灵敏度(～pmol水平的检测限)和重现性(变异系数
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Patent Agency Ranking
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公开(公告)号：CN116519778A
公开(公告)日：2023-08-01
申请号：CN202310324870.3
申请日：2023-03-29
Applicant: 上海交通大学
IPC: G01N27/626
Abstract: 本发明公开了一种基于干血清片的癌症代谢诊断装置及其性能评估方法，涉及医疗领域，包括干血清片、质谱仪、机器学习模块，所述干血清片在萃取后与纳米颗粒耦合，通过纳米材料辅助激光解吸电离质谱获得的代谢指纹谱图，并通过机器学习算法获得诊断性能。通过比较与相应血清样本在相同的气体、温度和时间段内的代谢指纹谱图来判断诊断装置的稳定性能。本发明使得纳米颗粒增强激光解吸/电离质谱进行干基质点分析成为可能，能够在癌症诊断方面得到有效应用，从而减轻液体样本的储存负担，降低诊断成本。
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公开(公告)号：CN115440379A
公开(公告)日：2022-12-06
申请号：CN202211174833.0
申请日：2022-09-26
Applicant: 上海交通大学
Abstract: 本发明公开了一种多模态癌症识别装置及应用，涉及医学人工智能领域，该装置包括数据输入模块、特征处理模块和定量分析模块；其中，输入模块的输出作为所述特征处理模块的输入，特征处理模块的输出作为所述定量分析模块的输入，定量分析模块采用定量分析网络计算癌症的概率。该装置在代谢指纹图谱和临床检测标志物的数据分析中的应用。提供了一种基于代谢指纹图谱和临床检测标志物的多模态癌症识别方法、装置、计算设备和应用，结合代谢以及代谢的正交信息准确识别早期癌症，快速判别癌症相关的代谢标志物，为癌症早筛、标志物筛选提供更好的解决方案。
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公开(公告)号：CN112418072A
公开(公告)日：2021-02-26
申请号：CN202011308746.0
申请日：2020-11-20
Applicant: 上海交通大学 , 腾讯科技(深圳)有限公司
IPC: G06K9/00
Abstract: 本申请涉及一种数据处理方法、装置、计算机设备和存储介质。所述方法涉及谱图数据的预处理技术领域，所述方法包括：获取实验样本对应的原始谱图；对原始谱图进行等采样处理，获得质荷比统一的谱图；对质荷比统一的谱图进行去噪处理，获得去噪谱图；根据参考谱图中的谱图峰对去噪谱图进行谱图校正，得到校正后谱图；对校正后谱图进行谱图配准处理后，得到实验样本对应的预处理数据，预处理数据用于对实验样本进行成分分析。采用本方法能够极大地提升数据预处理效果，预处理数据可通过与机器学习方法结合的方式来分析代谢物信息，得出最终的生物化学解释。
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