一种基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法

    公开(公告)号:CN108998561B

    公开(公告)日:2022-05-03

    申请号:CN201811027099.9

    申请日:2018-09-04

    Abstract: 本发明提供一种基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法,所述方法包括:S1.构建接骨木转录组文库并测序,将测序结果进行拼接与组装成一个完整的转录组,取每条基因中最长的转录本作为Unigene,通过拼接得到混合Unigenes库;S2.对步骤S1中的混合Unigenes库进行SSR检测;S3.进行SSR引物设计,并鉴定SSR引物的多态性。本发明共设计出64148对SSR特异引物,通过试验优化方案得到了西洋接骨木荧光SSR‑PCR最优体系,在合成的100对荧光标记SSR引物中,有25对引物具有良好多态性。本发明基于转录组测序开发接骨木SSR引物的方法快捷、准确。

    一种接骨木SSR分子标记、引物组及其在构建接骨木指纹图谱中的应用

    公开(公告)号:CN119101760A

    公开(公告)日:2024-12-10

    申请号:CN202411462280.8

    申请日:2024-10-18

    Abstract: 本发明属于植物种质资源鉴定技术领域,具体涉及一种接骨木SSR分子标记、引物组及其在构建接骨木指纹图谱中的应用。具体的,本发明利用16组SSR分子标记对收集的287份接骨木种质资源(含16个新品种:‘天然红1号’、‘天然红2号’、‘天山美棱’、‘青墨’、‘晚红’、‘水丹’、‘柳叶红’、‘紫丰’、‘金幻’、‘红丰’、‘盐丹’、‘泉丹’、‘黑美人’、‘黑珍珠’、‘红玛瑙’和‘金穗’)进行了遗传变异和多样性分析,并对16个品种进行了指纹图谱构建,从而为接骨木种质资源的管理、利用及新品种选育提供数据参考,因此具有良好的实际应用之价值。

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