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公开(公告)号:CN112501317B
公开(公告)日:2022-10-04
申请号:CN202011578229.5
申请日:2020-12-28
Applicant: 厦门大学
IPC: C12Q1/6888 , C12Q1/6858
Abstract: 一组可应用于大黄鱼抗刺激隐核虫育种的SNP标记,涉及分子辅助选择育种领域。公开其在大黄鱼基因组(BioProject:PRJNA505758)上的物理位置。基于全基因组关联分析,并通过全基因组选择模型优化找到一组(670个)可使模型预测准确性达到最佳的SNP分子标记集合,利用这组SNP标记培育的抗刺激隐核虫子代在攻毒验证中,表现出良好的抗虫性能。提供的与大黄鱼抗刺激隐核虫相关的分子标记,可快速将其应用到育种产业中,短时间之内就可培育高抗性的后代,减少了刺激隐核虫对大黄鱼养殖产业造成的经济损失,具有广阔的应用前景和商业价值。
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公开(公告)号:CN112410435A
公开(公告)日:2021-02-26
申请号:CN202010899506.6
申请日:2020-08-31
Applicant: 厦门大学 , 宁德市富发水产有限公司
IPC: C12Q1/6888 , C40B40/06 , C40B50/00
Abstract: 一种大黄鱼基因组育种芯片及应用,涉及基因组学、生物信息学、分子生物学和基因组育种技术领域。提供一种大黄鱼全基因组育种芯片,命名为宁芯1号,是基于Thermofisher公司的Affymetrix基因芯片技术制造的。每张芯片可以同时检测96个样本,包含591,765个高质量的SNP位点,这些SNP位点具有SEQ ID NO.l至SEQ ID NO.591765所示的核苷酸序列。该芯片可在检测大黄鱼DNA样品中的应用,可以对大黄鱼育种材料的进行遗传背景分析,可以对黄鱼属近缘物种进行基因型鉴定,对大黄鱼经济性状进行关联分析;通量高、重复性好、数据分析简单、单个标记数据成本低,具有广阔的应用前景。
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