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公开(公告)号：CN118853665A
公开(公告)日：2024-10-29
申请号：CN202410766641.1
申请日：2024-06-14
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12N15/113 , C12Q1/6895 , C12Q1/686 , G01N33/543 , G01N33/569 , G01N33/58 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了基于CRISPR/Cas12a的大白菜黑腐病检测方法及其相关材料和应用。具体公开了一种用于切割黑腐病rDNA‑ITS序列的Cas12a向导RNA分子，所述向导RNA分子包括靶向序列和结构序列，所述靶向序列的核酸序列为序列1的第4位‑第24位，所述结构的核酸序列为序列1的第25位‑第44位。使用向导RNA分子和及针对靶标设计的检测引物对待测样本进行Cas12a‑RPA检测，结果表明可快速、直观的检测到样本中是否含有目标基因组，可用于工农业生产。
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公开(公告)号：CN118599837A
公开(公告)日：2024-09-06
申请号：CN202410766644.5
申请日：2024-06-14
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12N15/113 , C12Q1/6895 , C12Q1/686 , G01N33/543 , G01N33/569 , G01N33/58 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了基于CRISPR/Cas12a的大白菜黄萎病检测方法及其相关材料和应用。具体公开了一种用于切割黄萎病rDNA‑ITS的Cas12a向导RNA分子，所述向导RNA分子包括靶向序列和结构序列，所述靶向序列的核酸序列为序列1的第4位‑第24位，所述结构的核酸序列为序列1的第25位‑第44位。使用向导RNA分子和及针对靶标设计的检测引物对待测样本进行cas12a‑RPA检测，结果表明可快速、直观的检测到样本中是否含有目标基因组，可用于工农业生产。
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公开(公告)号：CN108998556B
公开(公告)日：2021-06-18
申请号：CN201810994771.5
申请日：2018-08-29
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895
Abstract: 本发明公开了一种鉴定或辅助鉴定大白菜杂交结实率的SNP分子标记及其应用。本发明公开的SNP位点为BVRC_BrS2G/A位点，其位于大白菜基因组中的序列表中序列4自5’端第818位核苷酸，该位点为G/A多态。利用本发明所提供的BVRC_BrS2G/A位点及其所对应的引物鉴定大白菜杂交结实率的准确率达85.7％以上。由此表明，本发明所提供的BVRC_BrS2G/A位点及其所对应的引物将有助于杂交结实率高的大白菜种质资源的筛选，可用于分子标记辅助选择育种，为大白菜杂交亲和性性状的遗传改良提供材料储备和技术支持。
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公开(公告)号：CN105603088B
公开(公告)日：2020-01-03
申请号：CN201610071673.5
申请日：2016-02-02
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种鉴定位于白菜A08染色体上的霜霉病抗性QTL的SNP分子位点及其应用。本发明提供了A0817684339T/C位点在如下A‑F任一中的应用：A、在鉴别或辅助鉴别白菜霜霉病抗性中的应用；B、在选育白菜霜霉病抗病品种中的应用；C、白菜育种中的应用；D、预测白菜霜霉病抗性中的应用；E、在制备鉴别或辅助鉴别白菜霜霉病抗性产品中的应用；F、在制备预测白菜霜霉病抗性产品中的应用。本发明的实验证明了，本发明所提供的SNP位点及其特异引物可以对白菜霜霉病抗性良好分型，具有良好的应用价值，可实现对抗霜霉病遗传材料的的预先选择和辅助育种。
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公开(公告)号：CN105506130B
公开(公告)日：2019-03-08
申请号：CN201610025560.1
申请日：2016-01-15
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12Q1/6895 , C12N15/11
Abstract: 本发明公开了一种鉴定白菜病毒病TuMV‑C4小种抗性的、定位于A09染色体的SNP分子标记及其应用。本发明的SNP分子标记由序列2所示的单链DNA分子、序列3所示的单链DNA分子和序列4所示的单链DNA分子组成。通过对92个单株组成的BC1群体对分子标记的验证结果显示：该SNP分子标记的选择准确率在85％以上，可用于分子标记辅助育种，并为进一步定位和克隆基因奠定了良好的基础。
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Patent Agency Ranking
公开(公告)号：CN108103239A
公开(公告)日：2018-06-01
申请号：CN201810178804.9
申请日：2018-03-05
Applicant: 北京市农林科学院 , 京研益农(北京)种业科技有限公司
IPC: C12Q1/6895 , A01H1/04
Abstract: 本发明公开了鉴定大白菜芜菁花叶病毒病抗性的SNP分子标记A045736268C/T及其应用。本发明提供了检测待测白菜基因组中A045736268C/T位点的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定待测白菜的芜菁花叶病毒抗性中的应用；本实验利用DH群体,通过苗期人工摩擦接种TuMV,借助已有的白菜基因组信息进行抗性基因定位和分子标记开发，初步研究表明大白菜TuMV的抗性基因位于A04号染色体上，所开发的与该抗性基因紧密连锁的SNP标记无论在抗病还是感病材料中的选择准确率均为100％，可用于分子标记辅助选择育种。该项研究将为大白菜芜菁花叶病毒病抗性基因的进一步定位克隆及种质资源创新奠定基础。
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公开(公告)号：CN106460063A
公开(公告)日：2017-02-22
申请号：CN201580030487.0
申请日：2015-11-26
Applicant: 北京市农林科学院
CPC classification number: C12Q1/68 , C12Q1/6895 , C12Q1/6806 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了一种用于白菜遗传多样性分析及分子育种的SNP组合及其应用。本发明所提供的应用具体为571个SNP位点或用于检测所述571个SNP位点的物质在如下任一中的应用：(1)构建白菜DNA指纹数据库；(2)白菜种质资源遗传多样性分析和/或进化分析；(3)白菜分子育种；所述571个SNP位点的物理位置是基于白菜品种Chiifu-402-2的全基因组序列比对确定的，所述白菜品种Chiifu-402-2的全基因组序列的版本号为V1.5；所述571个SNP位点是BrSNPA01001-BrSNPA10043。实验证明，这571个SNP位点能够应用于白菜遗传多样性分析、进化分析；同时这571个SNP位点还可用于白菜分子育种，为其提供重要的技术支撑。
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公开(公告)号：CN105779581A
公开(公告)日：2016-07-20
申请号：CN201510837629.6
申请日：2015-11-26
Applicant: 北京市农林科学院
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/156
Abstract: 本发明公开了一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的核心SNP标记及其应用。本发明基于10个白菜核心资源的重测序，发掘了白菜全基因组的序列变异，筛选了一套适于大白菜品种核酸指纹数据库构建的96组SNP核心引物。本发明的96组SNP核心引物具有较高的多态性信息量、最小等位基因频率以及较低的期望杂合度，能够准确的对329份商业品种进行鉴别，并且基因分型结果稳定。本发明提供的SNP位点和检测方法可应用于大白菜的遗传多样性分析和品种核酸指纹库构建等研究，可为新品种的特异性、一致性、稳定性检测体系的建立和新品种保护提供技术支持。同时，可建立对大白菜品种的高通量、低成本和标准化的检测体系。
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公开(公告)号：CN105506163A
公开(公告)日：2016-04-20
申请号：CN201610072885.5
申请日：2016-02-02
Applicant: 北京市农林科学院
CPC classification number: C12Q1/6895 , C12Q2600/13 , C12Q2600/156 , C12Q2600/172
Abstract: 本发明公开了一种鉴定控制白菜紫色性状形成的SNP分子标记及其应用。A0331593020T/A位点在如下A-F任一中的应用：A、在鉴别或辅助鉴别大白菜颜色中的应用；B、在选育紫色大白菜品种中的应用；C、大白菜育种中的应用；D、预测大白菜颜色中的应用；E、在制备鉴别或辅助鉴别大白菜颜色产品中的应用；F、在制备预测大白菜颜色产品中的应用。本发明通过实验证明，利用A0331593020T/A位点及其所对应的引物无论在紫色还是在绿色材料中的选择准确率均为100％。表明该位点及其所对应的引物将有助于紫色大白菜种质资源的筛选，为大白菜紫色性状的遗传改良提供材料储备和技术支持。
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公开(公告)号：CN118546931A
公开(公告)日：2024-08-27
申请号：CN202410766646.4
申请日：2024-06-14
Applicant: 北京市农林科学院
IPC: C12N15/113 , C12Q1/6895 , C12Q1/686 , G01N33/543 , G01N33/569 , G01N33/58 , C12N15/11 , C12R1/645
Abstract: 本发明公开了基于CRISPR/Cas12a的大白菜霜霉病检测方法及其相关材料和应用。具体公开了一种用于切割霜霉菌rDNA‑ITS序列的Cas12a向导RNA分子，所述向导RNA分子包括靶向序列和结构序列，所述靶向序列的核酸序列为序列1的第4位‑第24位，所述结构的核酸序列为序列1的第25位‑第44位。使用向导RNA分子和及针对靶标设计的检测引物对待测样本进行cas12a‑RPA检测，结果表明可快速、直观的检测到样本中是否含有目标基因组，可用于工农业生产。
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