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公开(公告)号：CN116805508A
公开(公告)日：2023-09-26
申请号：CN202310288886.3
申请日：2023-03-22
Applicant: 东北林业大学
IPC: G16B20/00 , G16B40/00 , G06N3/0442 , G06N3/084
Abstract: 一种组织特异性eRNA的识别方法，具体涉及一种基于深度学习的组织特异性eRNA的识别方法，为解决eRNA识别方法仅依赖eRNA的序列特征进行识别，导致识别结果的准确率不高的问题。它包括获取某组织的eRNA数据集和非增强子数据集，以及此组织不同年龄样本的多种组蛋白修饰数据；提取每个eRNA和每个非增强子的序列特征，以及每个eRNA和每个非增强子在不同年龄样本下的每种组蛋白修饰特征；合并此组织中所有eRNA和非增强子在每个年龄样本下的多种组蛋白修饰特征，利用聚类和投票得到此组织的RE和AE，将RE和AE加入此组织中不同年龄样本的组蛋白修饰特征，通过深度神经网络模型识别组织特异性eRNA。属于生物信息学领域。
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