一种人鼻病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN115029477A

    公开(公告)日:2022-09-09

    申请号:CN202111354809.0

    申请日:2021-11-16

    申请人: 江汉大学

    IPC分类号: C12Q1/70 C12Q1/686 C12N15/11

    摘要: 本发明公开了一种人鼻病毒的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在人鼻病毒基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑5的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQID NO.10所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定人鼻病毒并精细的区分不同的亚型;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、免培养的检测优势,可应用于大规模样本的人鼻病毒的鉴定和遗传变异检测,对人鼻病毒的科研、医学监测具有重要意义。

    用于马铃薯品种鉴定的MNP标记位点、引物组合物和试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN114875164A

    公开(公告)日:2022-08-09

    申请号:CN202111600566.4

    申请日:2021-12-24

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本发明公开了一种用于马铃薯品种鉴定的MNP标记位点、引物组合物和试剂盒及其应用,所述MNP标记位点为在马铃薯基因组上筛选的在马铃薯种群内具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括马铃薯基因组GCA_009827175.1上MNP‑1~MNP‑560的标记位点。所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.1120所示。所述MNP标记位点数目多、多态性高、品种区分能力强,满足马铃薯品种真实性鉴定和实质性派生品种鉴定需求;所述引物互不干扰,鉴定准确度高、结果重现性强,满足DNA指纹数据库构建的要求;可应用于大规模马铃薯品种鉴定,在农作物产品的市场监管、知识产权保护、新品种培育等方面具有极大的应用价值。

    一种霍氏鲍特菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN114790487A

    公开(公告)日:2022-07-26

    申请号:CN202111301123.5

    申请日:2021-11-04

    申请人: 江汉大学

    IPC分类号: C12Q1/689 C12N15/11 C12R1/01

    摘要: 本发明公开了一种霍氏鲍特菌的MNP标记位点、引物组合物、试剂盒及其应用,所述MNP标记位点是指在霍氏鲍特菌基因组上筛选的区分于其他物种且在物种内部具有多个核苷酸多态性的基因组区域,包括MNP‑1~MNP‑16的标记位点;所述引物如SEQ ID NO.1~SEQ ID NO.32所示。所述MNP标记位点能特异的鉴定霍氏鲍特菌并精细的区分不同的亚型;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记位点进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏和免培养的检测优势,可应用于大规模样本的霍氏鲍特菌的鉴定和遗传变异检测,对霍氏鲍特菌的科研和医学监测具有重要意义。

    一种甲、乙和丙型流感病毒的MNP标记组合、引物对组合、试剂盒及其应用

    公开(公告)号:CN114277186A

    公开(公告)日:2022-04-05

    申请号:CN202111309400.7

    申请日:2021-11-06

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本发明属于分子生物学技术领域,本发明公开了一种甲、乙和丙型流感病毒的MNP标记组合、引物对组合、试剂盒及其应用,所述MNP标记组合包括265个标记,具体的核苷酸序列如SEQ ID NO.1‑SEQ ID NO.265所示;所述引物对组合包括265对引物,具体的引物核苷酸序列如SEQ ID NO.266‑SEQ ID NO.795所示所示。所述MNP标记组合能特异的鉴定3种流感病毒并精细的区分每种流感病毒不同的亚型;所述引物互不干扰,综合多重扩增和测序技术,可一次性对多样本的所有标记组合进行序列分析,具有高通量、多靶点、高灵敏和精准分型的检测优势,可应用于医学、食品、环境、海关等领域大规模样本的甲、乙和丙型流感病毒的鉴定和流行株的监测,具有广泛的应用范围,对甲、乙和丙型流感病毒的监测和防治具有重要意义。

    一种基于高通量测序和探针富集的鉴定转基因事件的方法

    公开(公告)号:CN113957130A

    公开(公告)日:2022-01-21

    申请号:CN202111133102.7

    申请日:2021-09-27

    申请人: 江汉大学

    摘要: 本申请涉及生物信息学技术领域,尤其涉及一种基于高通量测序和探针富集的快速鉴定转基因事件的方法。所述方法包括以下步骤:得到目标生物体的靶外源基因序列、所述靶外源基因序列的捕获探针、若干待标识的DNA片段和参考基因组序列;得到含接头的所述DNA片段;使用所述捕获探针对所述含接头的DNA片段中的靶外源基因进行捕获与文库构建,得到富集文库;对所述富集文库进行高通量测序,得到高通量测序数据;用所述高通量测序数据中的DNA序列分别与所述参考基因组序列和所述靶外源基因进行比对,确定所述靶外源基因插入所述目标生物体基因组上的位置。本方法无需全基因组测序,大大节省了成本,而且可用于转入外源基因或者载体不清楚的转基因材料。