一种与西瓜卷须退化和自封顶相关的分子标记及其应用

    公开(公告)号:CN114807409A

    公开(公告)日:2022-07-29

    申请号:CN202210247033.0

    申请日:2022-03-14

    摘要: 本发明公开了一种与西瓜卷须退化和自封顶相关的分子标记及其应用。本发明对西瓜卷须退化且自封顶材料TL‑DF和正常卷须无限生长型材料三白瓜进行全基因组测序,通过与参考基因组97103v2的序列比较开发SNP和INDEL分子标记,利用TL‑DF和三白瓜杂交再分别构建BC1和F2分离群体,发现卷须退化和自封顶性状共同出现,由同一个基因位点控制。通过BSA‑seq方法将卷须退化和自封顶基因初步定位于西瓜4号染色体,进而利用BC1分离群体对卷须退化和自封顶基因进行精细定位,开发出与两个性状共分离的分子标记ID_PB3。通过实验证明:本发明的分子标记ID_PB3在西瓜自然群体中与卷须退化和自封顶性状共分离,可以用于西瓜的分子标记辅助育种。

    一种检测西瓜枯萎病抗性的KASP标记及其应用

    公开(公告)号:CN117025833A

    公开(公告)日:2023-11-10

    申请号:CN202311210311.6

    申请日:2023-09-19

    摘要: 本发明公开了一种检测西瓜枯萎病抗性的KASP标记及其应用。本发明利用高抗枯萎病西瓜材料X97792和感枯萎病西瓜材料DW133构建的遗传分离群体将西瓜抗枯萎病基因Fo‑1精细定位于西瓜1号染色体117kb的区间内。结合2个亲本材料以及12份其他西瓜自交系的基因组重测序数据获得一个与西瓜枯萎病抗性性状共分离的SNP位点,基于该SNP位点开发了一种用于检测西瓜枯萎病抗性的KASP标记引物组合,包括如下三条引物:序列表中序列2所示的正向引物1,序列表中序列3所示的正向引物2和序列表中序列4所示的通用反向引物。本发明还提供了含有上述KASP引物组合的试剂盒,及上述引物组合和试剂盒的应用。本发明提供的引物组合和试剂盒可用于西瓜枯萎病抗性转育的分子标记辅助选择,提高育种效率。