公开(公告)号：CN119476423A

公开(公告)日：2025-02-18

申请号：CN202411610104.4

申请日：2024-11-12

Applicant: 华中科技大学

Inventor： 潘林强 ,  张子潇 ,  徐飞 ,  刘祖奇 ,  陈奎廷 ,  黄思健

IPC: G06N3/123

Abstract: 本申请提供了一种基于混合编码策略的高效DNA存储方法、系统，涉及DNA数据存储技术领域，旨在实现将数据稳定、高效地存储到DNA序列。方法包括：对待存储的原始数据进行统计分析，得到数据属性；根据数据属性和编码需求，确定混合编码器的编码算法和参数设置；将原始数据转换为二进制数据，并根据预设DNA序列长度、混合编码器的编码算法和参数设置，对二进制数据进行划分和分块编码，得到带有冗余的码字序列；根据二进制数据到四位碱基的映射关系，将带有冗余的码字序列进行转换，得到数据存储DNA序列；根据原始数据和所述混合编码器，为数据存储DNA序列添加引物和标记位，得到最终的数据存储DNA序列。

公开(公告)号：CN119332361A

公开(公告)日：2025-01-21

申请号：CN202411627562.9

申请日：2024-11-14

Applicant: 华中科技大学

Inventor： 潘林强 ,  刘祖奇 ,  徐飞 ,  张子潇

IPC: D01F1/10 ,  D01F8/10 ,  G11C11/54

Abstract: 本申请提供了一种DNA数据存储方法和芯壳纤维，涉及DNA数据存储技术领域，所述方法包括：对待存储信息进行编码，合成搭载所述待存储信息的DNA分子；利用所述DNA分子、DNA稳定液和封装材料，制备芯层电纺丝液；利用壳材封装材料，制备壳层电纺丝液；利用所述芯层电纺丝液和所述壳层电纺丝液，通过同轴静电纺丝技术进行电纺丝，得到芯壳纤维，所述芯壳纤维包括芯层和壳层，所述芯层中存储有所述DNA分子，所述壳层包裹所述芯层，形成同轴复合结构。

公开(公告)号：CN118138060A

公开(公告)日：2024-06-04

申请号：CN202410177807.6

申请日：2024-02-08

Applicant: 之江实验室 ,  华中科技大学

Inventor： 潘林强 ,  陈婉青 ,  徐飞 ,  张子潇 ,  刘祖奇

IPC: H03M13/27 ,  H03M13/29 ,  G16B50/50 ,  G16B50/30

Abstract: 本发明提供了一种基于卷积码的无索引编码高密度DNA存储方法、系统，涉及DNA数据存储技术领域。所述方法包括：获取卷积编码器的参数设置、卷积矩阵和原始数据；对原始数据进行转换，得到四进制数据；基于卷积编码器的参数设置、卷积矩阵和预设DNA长度对四进制数据进行分块卷积编码，得到卷积编码矩阵；按照矩阵列对卷积编码矩阵进行划分，得到至少一个字符序列；对每个字符序列进行转换，得到多个DNA序列。本发明提供的方法中，长二进制信息被分离成短片段。由于卷积编码的特性，每个短片段的编码结果不仅与它自己的信息比特有关，而且与前一个短片段的信息比特也有关。本发明可以利用每个短片段的信息相关性来去除索引段并增加存储密度。

公开(公告)号：CN118118034A

公开(公告)日：2024-05-31

申请号：CN202410177806.1

申请日：2024-02-08

Applicant: 之江实验室 ,  华中科技大学

Inventor： 潘林强 ,  黄思健 ,  陈婉青 ,  徐飞 ,  张子潇 ,  刘祖奇

IPC: H03M7/40 ,  H03M7/04

Abstract: 本发明提供了一种八碱基霍夫曼压缩轮转编码方法及装置，涉及DNA数据存储技术领域。所述方法包括：通过霍夫曼压缩将原始数据压缩为六进制数据；基于六种碱基排列对所述六进制数据进行轮转编码，得到碱基序列。本发明，利用非天然碱基(P、B、S、Z)参与DNA序列的合成，并利用霍夫曼压缩处理数据可以增加DNA数据存储的存储密度，本发明实施例中，还提出对霍夫曼压缩处理得到的六进制数据进行轮转编码，避免碱基S连续出现、碱基Z连续出现以及碱基S和碱基Z连续出现，从而避免后续DNA测序过程中Hel308解旋酶的解离，造成测序结果错误。