公开(公告)号：CN106018535B

公开(公告)日：2018-11-09

申请号：CN201610309699.9

申请日：2016-05-11

Applicant: 中国科学院计算技术研究所

Inventor： 曾文锋 ,  刘铭琪 ,  张晓今 ,  吴建强 ,  张扬 ,  孙瑞祥 ,  杨芃原 ,  贺思敏

IPC: G01N27/62

Abstract: 本发明提供一种完整糖肽鉴定的方法，包括：对于任一待鉴定的实测串联质谱，遍历糖链结构数据库，对于其中每个糖链结构：根据当前串联谱图的母离子质量，推断出碎裂测试中所有可能获得的糖肽Y离子的质量，进而计算匹配到当前二级谱图的谱峰的数目，并将这个匹配谱峰的数目作为对应情形下的糖肽Y离子与当前二级谱图匹配的粗打分结果；取粗打分前K名的糖链结构作为候选糖链结构；对于当前串联谱图，遍历所有的候选糖链结构，对于每一候选糖链结构进行实测谱和肽段的理论谱的谱谱匹配打分，以及实测谱和糖链结构的理论谱的谱谱匹配打分，进而得出糖肽结构鉴定结果。本发明能够提高完整糖肽规模化鉴定的可靠性且计算复杂度低。

公开(公告)号：CN106018535A

公开(公告)日：2016-10-12

申请号：CN201610309699.9

申请日：2016-05-11

Applicant: 中国科学院计算技术研究所

Inventor： 曾文锋 ,  刘铭琪 ,  张晓今 ,  吴建强 ,  张扬 ,  孙瑞祥 ,  杨芃原 ,  贺思敏

IPC: G01N27/62

CPC classification number: G01N27/62

Abstract: 本发明提供一种完整糖肽鉴定的方法，包括：对于任一待鉴定的实测串联质谱，遍历糖链结构数据库，对于其中每个糖链结构：根据当前串联谱图的母离子质量，推断出碎裂测试中所有可能获得的糖肽Y离子的质量，进而计算匹配到当前二级谱图的谱峰的数目，并将这个匹配谱峰的数目作为对应情形下的糖肽Y离子与当前二级谱图匹配的粗打分结果；取粗打分前K名的糖链结构作为候选糖链结构；对于当前串联谱图，遍历所有的候选糖链结构，对于每一候选糖链结构进行实测谱和肽段的理论谱的谱谱匹配打分，以及实测谱和糖链结构的理论谱的谱谱匹配打分，进而得出糖肽结构鉴定结果。本发明能够提高完整糖肽规模化鉴定的可靠性且计算复杂度低。