一种基于转录组测序开发SSR引物的方法

    公开(公告)号:CN108034696A

    公开(公告)日:2018-05-15

    申请号:CN201810106397.0

    申请日:2018-02-02

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于转录组测序开发SSR引物的方法。该方法基于已有的全基因组序列数据及其注释,针对其基因组外显子序列筛选候选SSR位点并设计SSR扩增引物。然后基于多个个体转录组测序的数据进行ePCR验证,最终筛选出多态性好的SSR位点并得到其扩增引物。本发明提供的方法与过去采用的实验室PCR与聚丙烯酰胺凝胶电泳大大减少了开发周期和人力,而且相比采用实验室PCR与测序分型的筛选方法相比大大减少了开发周期和开发经费。本发明提出的方法不仅适用于SSR引物开发,还适用于所有具有参考基因组物种的SSR引物开发,具有广泛的应用前景。

    一种基于转录组测序开发SSR引物的方法

    公开(公告)号:CN108034696B

    公开(公告)日:2020-07-28

    申请号:CN201810106397.0

    申请日:2018-02-02

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于转录组测序开发SSR引物的方法。该方法基于已有的全基因组序列数据及其注释,针对其基因组外显子序列筛选候选SSR位点并设计SSR扩增引物。然后基于多个个体转录组测序的数据进行ePCR验证,最终筛选出多态性好的SSR位点并得到其扩增引物。本发明提供的方法与过去采用的实验室PCR与聚丙烯酰胺凝胶电泳大大减少了开发周期和人力,而且相比采用实验室PCR与测序分型的筛选方法相比大大减少了开发周期和开发经费。本发明提出的方法不仅适用于SSR引物开发,还适用于所有具有参考基因组物种的SSR引物开发,具有广泛的应用前景。

    一种基于分子标记培育人类疾病动物模型的方法

    公开(公告)号:CN117457070A

    公开(公告)日:2024-01-26

    申请号:CN202311343853.0

    申请日:2023-10-17

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明公开了一种基于分子标记培育人类疾病动物模型的方法,属于动物模型培育技术领域。所述基于分子标记培育人类疾病动物模型的方法,具体包括以下步骤:(1)构建模式动物染色体水平的高质量基因组图谱;(2)筛选模式动物的人类疾病易感SNP位点和基因;(3)建立模式动物人类疾病分子标记物的优化体系;(4)筛选模式动物人类疾病发生个体。本发明通过与目标性状相联的分子标记物进行亲本选育,使目标性状基因逐步富集于后代,逐步提高目标性状的表现。选育不受环境影响,选择结果可靠,不但能显著提高低遗传力性状,还能大大缩短育种周期。为自发性人类疾病动物模型的培育提供了新的思路。

    一种提取毛发DNA的方法
    6.
    发明授权

    公开(公告)号:CN105950614B

    公开(公告)日:2019-04-09

    申请号:CN201610581322.9

    申请日:2016-07-21

    Applicant: 中南大学

    Abstract: 本发明公开了一种毛发总DNA提取方法,该方法基于PCR缓冲液法和CTAB法改良之后得到。该方法取毛发近毛囊段,经过无水乙醇和蒸馏水洗涤干燥后,在加有SDS和蛋白酶K的PCR缓冲液中消化后,加入RNA酶去除RNA,然后在高盐环境下加入CTAB结合蛋白质,最后经过氯仿异戊醇抽提,异丙醇沉淀,70%乙醇洗涤,最终得到总DNA样品。该方法针对毛发的特点,兼具PCR缓冲液法能充分释放毛发DNA和改良的CTAB法能高效抽提和纯化DNA的优点。提取过程对毛发DNA释放充分,对蛋白质等杂质去除彻底,且避免了有毒易挥发的苯酚的使用,得到的总DNA相对纯度高,得率好,完整性高,具有广泛的应用前景。

    一种提取毛发DNA的方法
    7.
    发明公开

    公开(公告)号:CN105950614A

    公开(公告)日:2016-09-21

    申请号:CN201610581322.9

    申请日:2016-07-21

    Applicant: 中南大学

    CPC classification number: C12N15/1003

    Abstract: 本发明公开了一种毛发总DNA提取方法,该方法基于PCR缓冲液法和CTAB法改良之后得到。该方法取毛发近毛囊段,经过无水乙醇和蒸馏水洗涤干燥后,在加有SDS和蛋白酶K的PCR缓冲液中消化后,加入RNA酶去除RNA,然后在高盐环境下加入CTAB结合蛋白质,最后经过氯仿异戊醇抽提,异丙醇沉淀,70%乙醇洗涤,最终得到总DNA样品。该方法针对毛发的特点,兼具PCR缓冲液法能充分释放毛发DNA和改良的CTAB法能高效抽提和纯化DNA的优点。提取过程对毛发DNA释放充分,对蛋白质等杂质去除彻底,且避免了有毒易挥发的苯酚的使用,得到的总DNA相对纯度高,得率好,完整性高,具有广泛的应用前景。

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